Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp3Q923K4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gtpbp3Q923K4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gtpbp3Q923K4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Gtpbp3Q923K4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp3Q923K4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Gtpbp3Q923K4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp3Q923K4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp3Q923K4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp3Q923K4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp3Q923K4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Gtpbp3Q923K4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp3Q923K4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Gtpbp3Q923K4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Gtpbp3Q923K4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp3Q923K4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp3Q923K4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp3Q923K4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp3Q923K4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp3Q923K4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp3Q923K4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp3Q923K4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp3Q923K4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp3Q923K4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp3Q923K4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp3Q923K4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp3Q923K4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp3Q923K4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp3Q923K4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp3Q923K4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp3Q923K4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp3Q923K4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp3Q923K4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp3Q923K4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp3Q923K4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp3Q923K4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp3Q923K4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms