Protein–RNA interactions for Protein: Q923B1

Dbr1, Lariat debranching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbr1Q923B1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dbr1Q923B1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dbr1Q923B1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms