Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms