Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Afg3l1Q920A7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms