Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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Pde6cQ91ZQ1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pde6cQ91ZQ1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pde6cQ91ZQ1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pde6cQ91ZQ1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pde6cQ91ZQ1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pde6cQ91ZQ1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pde6cQ91ZQ1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde6cQ91ZQ1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde6cQ91ZQ1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde6cQ91ZQ1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Pde6cQ91ZQ1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde6cQ91ZQ1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde6cQ91ZQ1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Pde6cQ91ZQ1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Pde6cQ91ZQ1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde6cQ91ZQ1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde6cQ91ZQ1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Pde6cQ91ZQ1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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