Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l3Q91XE9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms