Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms