Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn8Q91VA3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms