Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ApofQ91V80 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms