Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms