Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc71Q8VEG0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc71Q8VEG0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms