Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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