Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms