Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ8

Rpusd1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1Q8VCZ8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpusd1Q8VCZ8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd1Q8VCZ8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms