Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnajc28Q8VCE1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnajc28Q8VCE1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnajc28Q8VCE1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnajc28Q8VCE1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnajc28Q8VCE1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnajc28Q8VCE1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnajc28Q8VCE1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnajc28Q8VCE1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms