Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med17Q8VCD5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms