Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4Y8

Rttn, Rotatin, mousemouse

Predictions only

Length 2,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RttnQ8R4Y8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms