Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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