Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms