Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms