Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trim29Q8R2Q0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim29Q8R2Q0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms