Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms