Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZW7

Gabrp, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabrpQ8QZW7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabrpQ8QZW7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms