Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc5Q8K4Z2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fndc5Q8K4Z2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fndc5Q8K4Z2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fndc5Q8K4Z2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fndc5Q8K4Z2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fndc5Q8K4Z2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fndc5Q8K4Z2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc5Q8K4Z2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc5Q8K4Z2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc5Q8K4Z2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc5Q8K4Z2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc5Q8K4Z2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms