Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms