Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms