Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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