Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sash3Q8K352 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms