Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms