Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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Trappc12Q8K2L8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms