Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd3Q8K2F0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms