Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms