Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Cldn34c1Q8K193 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Cldn34c1Q8K193 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Cldn34c1Q8K193 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Cldn34c1Q8K193 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Cldn34c1Q8K193 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Cldn34c1Q8K193 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Cldn34c1Q8K193 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c1Q8K193 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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