Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms