Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf628Q8CJ78 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms