Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms