Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog3Q8CI04 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms