Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ep400Q8CHI8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms