Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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