Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tshz3Q8CGV9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tshz3Q8CGV9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tshz3Q8CGV9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tshz3Q8CGV9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tshz3Q8CGV9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tshz3Q8CGV9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tshz3Q8CGV9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tshz3Q8CGV9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tshz3Q8CGV9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tshz3Q8CGV9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tshz3Q8CGV9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tshz3Q8CGV9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tshz3Q8CGV9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tshz3Q8CGV9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tshz3Q8CGV9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tshz3Q8CGV9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tshz3Q8CGV9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tshz3Q8CGV9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tshz3Q8CGV9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tshz3Q8CGV9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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