Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms