Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Setd1bQ8CFT2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms