Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF31

Uncharacterized protein C11orf94 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CF31 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8CF31 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8CF31 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF31 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF31 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF31 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF31 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF31 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF31 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF31 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF31 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF31 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF31 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF31 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF31 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF31 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF31 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF31 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF31 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF31 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF31 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF31 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF31 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF31 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF31 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF31 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CF31 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CF31 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CF31 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CF31 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CF31 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CF31 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CF31 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CF31 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CF31 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CF31 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CF31 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CF31 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CF31 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CF31 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CF31 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CF31 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CF31 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CF31 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF31 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF31 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF31 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF31 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF31 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF31 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF31 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF31 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF31 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF31 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF31 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF31 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF31 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF31 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF31 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF31 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF31 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF31 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF31 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF31 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF31 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF31 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF31 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF31 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF31 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF31 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF31 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF31 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF31 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF31 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF31 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF31 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF31 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF31 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF31 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF31 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF31 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF31 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF31 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF31 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CF31 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CF31 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CF31 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CF31 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CF31 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CF31 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CF31 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CF31 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CF31 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CF31 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CF31 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CF31 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CF31 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CF31 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CF31 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CF31 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms