Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras1Q8CEC5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms