Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrrc9Q8CDN9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms