Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms