Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lancl3Q8CD19 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms