Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn3Q8CBC6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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