Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms