Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fbxo48Q8CAT8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms